琼海市疾病预防控制中心坐落于美丽的万泉河畔，嘉积镇新海路，系全额编制副科级事业单位，是市疾病预防控制与卫生监测检验监测技术指导中心，承担全市传染病监测和控制、免疫规划、公共卫生突发事件处理和重大灾害防疫、健康相关产品的检验检测、鉴定和卫生学评价、健康教育与健康促进爱国卫生技术指导等任务。
中心坚持把公共卫生服务能力建设作为重点工作来抓，根据工作实际制定疾控服务能力建设规划，精心组织实施，建立健全工作责任制度，中心主要领导负总责任，指定分管领导具体负责，分步实施，重点突破，整体推进，确保各项建设目标、任务和措施落实到位。目前，全中心设有办公室、应急办公室、急性传染病预防控制组、免疫规划组、结核病预防控制组、公共卫生组、检验组、健康教育组、病媒生物监测与寄生虫病地方病预防控制组、后勤保障组、预防医学咨询服务部等11个内设机构。现有专业技术人员67 人，卫生技术人员共46人，其中副高级技术职称的5人，中级技术职称的16人，初级技术职务20人，本科学历26人，大专学历16人，中专及以下学历25人。
在市委、市政府和上级卫生主管部门的正确领导下，市疾控中心不断加强疾病预防控制体系建设，提升公共卫生服务能力，在事业发展上凝聚力量，有序推进，让疾控成果惠及民生。一是着力围筑健康屏障，防控传染病毫不松懈。强化监测技术保障，登革热、手足口病等重点传染病防控有力；二是积极巩固既往成果,以疟疾消除工作为重点，加强输入性疟疾病例的管理，保持无本地感染疟疾病例的成效。计划免疫成绩,继续保持无脊灰，保持高水平常规免疫接种率；三是提升技术服务能力，保障公共卫生安全；目前，我中心设置理化检验室、微生物检验室、国家流感监测网络实验室、寄生虫镜检室等多间功能实验室，现中心实验室拥有瑞士离子色谱1台，德国耶拿原子吸收光谱仪1台，中国原子荧光光度计1台，美国赛默飞气相色谱仪1台，美国ABI荧光定量PCR 1台等 54台高精密检测仪器，具备开展生活饮用水、食品、公共场所卫生、放射卫生、健康与门诊检查、消毒与杀虫、传染病防治等7类检测项目的130项参数的检测能力，并于2015年通过海南省质量技术监督检局的复评审，获得“海南省计量认证资质检验机构”、“食品检验机构资质实验室”。
“科学、务实、团结、奉献” 是疾控中心及疾控人的精神，中心先后取得“全国消灭脊髓灰质炎工作先进单位” 、 “海南省公共卫生监测工作先进单位” 、 “博鳌亚洲论坛2013年年会服务保障工作优秀奖” 等荣誉。中心将继续以坚持科学发展观，坚持以人为本, 诚实守信, 优质高效，努力为全市人民提供优质的疾控服务，为“打造田园城市 构建幸福琼海” 创建文明城市，提供坚强的健康保障。